Обобщаются исследования по проблемам взаимодействия микроорганизмов и беспозвоночных животных в почве. Рассматривается участие беспозвоночных в физических и биохимических процессах и их роль в жизни микробного комплекса почв. Анализируются особенности питания беспозвоночных животных микроорганизмами. Сформулировано новое представление о переваривании микроорганизмов беспозвоночными. Обсуждается значение феномена выборочного питания животных микроорганизмами в формировании микробных сообществ в почве. Анализируются особенности регуляторного воздействия беспозвоночных на почвенные микроорганизмы. Сформулирована концепция трофических и метаболических механизмов регуляции животными микробного комплекса почв. Рассматриваются типы симбиозов микроорганизмов и беспозвоночных. Даётся характеристика таксономического состава бактерий и грибов, ассоциированных с почвенными беспозвоночными. Анализируется их функциональная роль в почве. Приводятся наиболее яркие способы биологического контроля почвенных беспозвоночных с использованием микроорганизмов.