В решении продовольственной безопасности животноводческий сектор занимает ведущее место в АПК страны. Современный животноводческий комплекс с его твердыми, жидкими и газообразными отходами является мощным антропогенным фактором негативного воздействия на природную среду. Химическое и биологическое загрязнение почвы отходами животноводства ставит под вопрос получение экологически безопасной продукции. Биогенные и органические вещества отходов и сточных вод, поступающие в грунтовые и поверхностные воды, ухудшают качество воды и делают ее непригодной для большинства водопользователей. Эмиссия парниковых газов в процессе получения переработки и хранения отходов животноводческого комплекса вносит существенный вклад в глобальное потепление климата планеты.
Экологизация и биологизация земледелия страны предусматривают масштабное использование органических удобрений. При неконтролируемом применении бесподстилочного навоза происходят миграция биогенных веществ с поверхностным и внутрипочвенным стоком, загрязнение грунтовых и поверхностных природных вод, эмиссия парниковых газов из почвы, химическое и биологическое загрязнение продукции растениеводства.
С помощью метода изотопной индикации показано участие азота органических удобрений в формировании микробной биомассы и органического вещества почвы, его роль в продукционном процессе возделываемых культур. Определены параметры получения экологически безопасной продукции.